William Alfred Waddel nasceu no estado de Nova Iorque (EUA) em 1862. Quando alcançou a idade adulta, graduou-se em Engenharia Civil e consecutivamente ingressou no Seminário de Princeton para estudar Teologia. Também se interessou pela Junta de Missões Estrangeiras e se tornou um associado como missionário.

Foi enviado ao Brasil no início dos anos de 1890 e foi recebido em São Paulo no Mackenzie College pelo diretor Horace Lane. Integrado a vida cotidiana da Escola, começou a lecionar nos cursos que eram oferecidos e foi o responsável por conduzir a construção do edifício John Theron Mackenzie. Com a inauguração da Escola de Engenharia, foi o primeiro diretor e um dos primeiros professores.

Posteriormente, ausentou-se de São Paulo e migrou para região nordeste do Brasil para expandir os sentidos missionários e lá fundou o Instituto Ponte Nova. Em 1914, dois anos após a morte de Horace Lane, foi convidado a assumir a presidência do Mackenzie College.

Ficou à frente da instituição até 1927 e, durante sua administração, o campus Higienópolis expandiu os seus edifícios e novos cursos passaram a ser oferecidos, aumentando assim a quantidade de alunos. Na década de 1930, tornou a ser presidente da instituição num período transitório. Também fundou na cidade de Jandira, em São Paulo, o Instituto José Manoel da Conceição, destinado à formação pré-teológica de pastores presbiterianos.

O edifício que leva seu nome foi inaugurado em 1929, a princípio destinado a salas de aula e laboratórios de física e eletricidade. Atualmente, atende a Faculdade de Direito.